JavaScriptでクラスの追加削除をする時、今まではjQueryならaddClass()、生で書く時はclassName()で追加と削除をしていましたが便利なclassListというのがあるみたいです、IE10以上なら大体動きます。
追加や削除が容易にできる他、クラスの切り替え（toggle）や特定のクラスを含むかどうか判定できるhasClassっぽいことも出来ます。
let logo = document.getElementsByClassName('header__logo');
logo[0].classList.add('header__logo--loaded'); //クラスの追加- add: クラスの追加、jQueryでいうところのaddClass()
- remove: クラスの削除、jQueryでいうところのremoveClass()
- toggle: クラスの切替、jQueryでいうところのtoggleClass()
- contains: 特定のクラスを含むか否かの確認、jQueryでいうところのhasClass()
「.header__logo」が「.header__logo–loaded」を含むかどうか判定するサンプル
let logo = document.getElementsByClassName('header__logo');
logo[0].classList.add('header__logo--loaded');
if (logo[0].classList.contains('header__logo--loaded')) {//.header__logo--loadedが含まれていればtrue.
console.log('クラス付与済み');
} else {
console.log('クラス無い');
}